מחלבת הכפר הירוק הוקמה כמחלבת בוטיק באפריל 2012 ליד רפת הכפר.

המחלבה הוקמה כיזמות עסקית וחינוכית המשלבת ייצור מוצרים איכותיים מחלב בקר והכשרת תלמידים בתחומי הייצור השונים.  המחלבה עוסקת בייצור ומכירה מיום א' עד ה' בין השעות 8:00 – 20:00 ובימי שישי וערבי חג  מ 8:00 עד 14:00

המחלבה מקבלת חלב טרי כל בוקר מהרפת ולאחר תהליך פסטור החלב מעובד למוצריו השונים כגון:  חלב לשתיה, יוגורטים, גבינות רכות, גבינות עובש, גבינות קשות וגלידות וכל זאת ללא חומרים משמרים.  את מוצרי המחלבה ניתן לרכוש בחנות הסמוכה לה. כל מוצרי המחלבה כשרים למהדרין. המחלבה מספקת חלק ממוצריה גם לחדר האוכל של הכפר.

במחלבה עובדים תלמידים המודרכים במקום ומלווים את פעילות המחלבה מקבלת החלב הטרי דרך הפסטור, הגיבון והאריזה.